Vào năm 1995, Phó Thủ tướng Malaysia Tun Dr. Mahathir bin Mohamad (hiện đang là đương kim tổng thống vừa đắc cử của Malaysia) được cử đi tham quan Viện Công Nghệ Massachusetts (Massachusetts Institute of Technology – MIT) và ủng hộ việc thành lập một trường Đại học mô hình tương tự với Viện Công Nghệ Massachusets tại Malaysia. Với định hướng này, vào tháng 1 năm 1997, thỏa thuận thành lập trường Đại học Khoa học và Công Nghệ Malaysia được ký kết.

Do được thành lập bởi chính phủ nên đại học MUST được sử dụng cụm “Malaysia” ngay trong tên của trường và cùng với sự kế thừa chương trình, mô hình và đội ngũ giảng viên được MIT đào tạo, đại học MUST đã duy trì và phát triển trở thành một đại học có nhiều thành tựu như hiện nay.

Với sự hình thành từ thoả thuận chính phủ và sự hỗ trợ xây dựng bởi MIT, trong bằng cấp của MUST thể hiện nội dung:

The Malaysia University of Science and Technology (MUST) was established with the assistance of the Massachusetts Institute of Technology (MIT), Cambridge, MA, USA, under the auspices of a collaborative agreement between MUST-Ehsan Foundation of Malaysia and MIT.